تُمثل المعاهد الخاصة السبعة في محافظة المنيا رافداً مهماً للتعليم العالي، حيث تقدم برامج أكاديمية متخصصة في مجالات الهندسة والتكنولوجيا والصحة والتمريض والسياحة والفنادق، وتسعى هذه المعاهد إلى تأهيل كوادر وطنية قادرة على المنافسة في سوق العمل.

ومن بين المعاهد الخاصة بالشعبة التجارية، المعهد العالي لتكنولوجيا الإدارة والمعلومات بالمنيا ويضم أقسام «العلوم الأساسية، إدارة الأعمال، المحاسبة، الرياضيات والإحصاء والتأمين، وقسم نظم المعلومات».

ويوجد أيضا في المنيا المعهد التكنولوجي للتمريض، وقبل الطلاب الحاصلين على الثانوية العامة علمي علوم، وما يعادلها من الشهادات العربية والأجنبية.

وتضم قائمة المعاهد الخاصة المعتمدة من التعليم العالي في محافظة المنيا «المعهد التكنولوجي العالي للإعلام، والمعهد التكنولوجي العالي للسياحة والفنادق، والمعهد التكنولوجي العالي للعلوم الصحية التطبيقية».